BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB019D09LP1|AL427482
(966 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1164 1699 0.0
3x_Contig1773 1604 0.0
3x_Contig1614 1604 0.0
3x_Contig894 1208 0.0
3x_Contig1790 1143 0.0
>3x_Contig1164
Length = 2302
Score = 1699 bits (855), Expect = 0.0
Identities = 919/934 (98%), Gaps = 7/934 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 7 ggttgataatttacaggtgcacaaatactagttgcagagggaaacatgtgaaabgccttc 66
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1516 ggttgataatttacaggtgcacaaataccagttgcagagggaaacatgtgaaaggccttc 1457
Query: 67 ctcaccaccggctctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 126
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1456 ctcaccaccggccctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 1397
Query: 127 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1396 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 1337
Query: 187 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1336 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 1277
Query: 247 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1276 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 1217
Query: 307 ahactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 366
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1216 aaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 1157
Query: 367 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1156 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 1097
Query: 427 ctcaagaaaaaaacctgtaaaacaaactgtaaaacaaaatgacagaagtcatagaatttg 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1096 ctcaagaaaaaaacctgtaaaacaaactgtaaaacaaaatgacagaagtcatagaatttg 1037
Query: 487 acgcagcctataccatgccgtcatgcctgggaattgagctgttcacgcgggagaggtgag 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1036 acgcagcctataccatgccgtcatgcctgggaattgagctgttcacgcgggagaggtgag 977
Query: 547 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattcgagttactctcga 605
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 976 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattcgagttactctcga 917
Query: 606 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaaaacacaa 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 916 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaaaacacaa 857
Query: 666 tggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgtttcgtgc 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 856 tggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgtttcgtgc 797
Query: 726 tcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgacaattggag 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 796 tcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgacaattggag 737
Query: 786 gagccgaaccttcgtatttggaagtcaaaaacggaatctttgtccactggtcacagcccg 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 736 gagccgaaccttcgtatttggaagtcaaaaacggaatctttgtccactggtcacagcccg 677
Query: 846 ggt-cmattgcactt-cagcccttgctctccttccttttgaagc-agagtgtc-atgcgc 901
||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 676 ggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtcaatgcgc 617
Query: 902 cgt-atccgaatgaggt-cmattcttagcgtcgg 933
||| ||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct: 616 cgtaatccgaatgaggtccaattcttagcgtcgg 583
>3x_Contig1773
Length = 8694
Score = 1604 bits (807), Expect = 0.0
Identities = 907/934 (97%), Gaps = 7/934 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 7 ggttgataatttacaggtgcacaaatactagttgcagagggaaacatgtgaaabgccttc 66
||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 4196 ggttgatgatttacaggtgcacaattaccagttgcagagggaaacatgtgaaaggccttc 4137
Query: 67 ctcaccaccggctctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 126
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4136 ctcaccaccggccctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 4077
Query: 127 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4076 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 4017
Query: 187 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4016 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 3957
Query: 247 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3956 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 3897
Query: 307 ahactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 366
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3896 aaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 3837
Query: 367 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3836 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 3777
Query: 427 ctcaagaaaaaaacctgtaaaacaaactgtaaaacaaaatgacagaagtcatagaatttg 486
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct: 3776 ctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcatagaatgtg 3717
Query: 487 acgcagcctataccatgccgtcatgcctgggaattgagctgttcacgcgggagaggtgag 546
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 3716 acgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggagaggtgag 3657
Query: 547 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattcgagttactctcga 605
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 3656 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattagagttactctcga 3597
Query: 606 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaaaacacaa 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3596 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaaaacacaa 3537
Query: 666 tggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgtttcgtgc 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3536 tggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgtttcgtgc 3477
Query: 726 tcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgacaattggag 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3476 tcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgacaattggag 3417
Query: 786 gagccgaaccttcgtatttggaagtcaaaaacggaatctttgtccactggtcacagcccg 845
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3416 gagccgaaccttcgtatctggaagtcaaaaacggaacctttgtccactggtcacagcccg 3357
Query: 846 ggt-cmattgcactt-cagcccttgctctccttccttttgaagc-agagtgtc-atgcgc 901
||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 3356 ggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtcaatgcgc 3297
Query: 902 cgt-atccgaatgaggt-cmattcttagcgtcgg 933
||| ||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct: 3296 cgtaatccgaatgaggtccaattcttagcgtcgg 3263
>3x_Contig1614
Length = 4869
Score = 1604 bits (807), Expect = 0.0
Identities = 907/934 (97%), Gaps = 7/934 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 7 ggttgataatttacaggtgcacaaatactagttgcagagggaaacatgtgaaabgccttc 66
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 3850 ggttgataatttacaggtgcacaaataccagttgcagagggaaacatgtgaaaggccttc 3791
Query: 67 ctcaccaccggctctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 126
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3790 ctcaccaccggccctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 3731
Query: 127 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3730 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 3671
Query: 187 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 246
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3670 ccaataggagagagtgatataccctataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 3611
Query: 247 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3610 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 3551
Query: 307 ahactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 366
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3550 aaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 3491
Query: 367 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3490 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 3431
Query: 427 ctcaagaaaaaaacctgtaaaacaaactgtaaaacaaaatgacagaagtcatagaatttg 486
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct: 3430 ctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcaaagaatgtg 3371
Query: 487 acgcagcctataccatgccgtcatgcctgggaattgagctgttcacgcgggagaggtgag 546
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 3370 acgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggagaggtgag 3311
Query: 547 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattcgagttactctcga 605
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 3310 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattagagttactctcga 3251
Query: 606 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaaaacacaa 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3250 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaaaacacaa 3191
Query: 666 tggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgtttcgtgc 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3190 tggagtatctgtcactggatctcgtttcaccagggtcaattttcactctgtgtttcgtgc 3131
Query: 726 tcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgacaattggag 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3130 tcctaataacgccttttgtccaaaagctcaacatgtcaccgaagttaacgacaattggag 3071
Query: 786 gagccgaaccttcgtatttggaagtcaaaaacggaatctttgtccactggtcacagcccg 845
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3070 gagccgaaccttcgtatctggaagtcaaaaacggaacctttgtccactggtcacagcccg 3011
Query: 846 ggt-cmattgcactt-cagcccttgctctccttccttttgaagc-agagtgtc-atgcgc 901
||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct: 3010 ggtccaattgcacttccagcccttgctctccttccttttgaagcaagagtgtcaatgcgc 2951
Query: 902 cgt-atccgaatgaggt-cmattcttagcgtcgg 933
||| ||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct: 2950 cgtaatccgaatgaggtccaattcttagcgtcgg 2917
>3x_Contig894
Length = 1786
Score = 1208 bits (608), Expect = 0.0
Identities = 666/683 (97%), Gaps = 3/683 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 7 ggttgataatttacaggtgcacaaatactagttgcagagggaaacatgtgaaabgccttc 66
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1102 ggttgataatttacaggtgcacaaataccagttgcagagggaaacatgtgaaaggccttc 1161
Query: 67 ctcaccaccggctctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 126
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1162 ctcaccaccggccctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 1221
Query: 127 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1222 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 1281
Query: 187 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1282 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 1341
Query: 247 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1342 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 1401
Query: 307 ahactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 366
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1402 aaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 1461
Query: 367 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1462 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 1521
Query: 427 ctcaagaaaaaaacctgtaaaacaaactgtaaaacaaaatgacagaagtcatagaatttg 486
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct: 1522 ctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcatagaatgtg 1581
Query: 487 acgcagcctataccatgccgtcatgcctgggaattgagctgttcacgcgggagaggtgag 546
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 1582 acgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggagaggtgag 1641
Query: 547 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattcgagttactctcga 605
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 1642 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattagagttactctcga 1701
Query: 606 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaaaaca-ca 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1702 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtctgcgtcaggatgggtaaaaaacacca 1761
Query: 665 atggagtatctgtc-actggatc 686
|||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 1762 atggagtatctgtctactggatc 1784
>3x_Contig1790
Length = 27369
Score = 1143 bits (575), Expect = 0.0
Identities = 619/634 (97%), Gaps = 1/634 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 7 ggttgataatttacaggtgcacaaatactagttgcagagggaaacatgtgaaabgccttc 66
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 639 ggttgataatttacaggtgcacaaataccagttgcagagggaaacatgtgaaaggccttc 580
Query: 67 ctcaccaccggctctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 126
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 579 ctcaccaccggccctcatgctggtcatttatgcagtcgtgttgtcaagttctagatccaa 520
Query: 127 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 519 agattcaaattcactcttcttttttcatcaaaataaatgactttttattatcagagtgtt 460
Query: 187 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 459 ccaataggagagagtgatataccttataactcatcagcgaatgttccgacgtatctcctt 400
Query: 247 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 399 cggagtatagcgttattcagtagcctcattactaggtacggtaagtattgggagtatata 340
Query: 307 ahactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 366
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 339 aaactatttgagggtacatgtcagggtttgaagttagtggctgacctgctcaatagcagt 280
Query: 367 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 279 taatcaagttagaaattcttcactctgtctgcctacagtagaaaattgaaaattaataat 220
Query: 427 ctcaagaaaaaaacctgtaaaacaaactgtaaaacaaaatgacagaagtcatagaatttg 486
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct: 219 ctcaaaaaaaaaacctgtaaaaaaaactgtaaaacaaaatgaaagaagtcatagaatgtg 160
Query: 487 acgcagcctataccatgccgtcatgcctgggaattgagctgttcacgcgggagaggtgag 546
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct: 159 acgcagcctataccatgccgtcatgactgggaattgagttgatcacgcgggagaggtgag 100
Query: 547 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggagg-cncccaatgccattcgagttactctcga 605
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 99 cagacaaatactcgtaagccgtcaccggaggtgccccaatgccattagagttactctcga 40
Query: 606 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtc 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39 tgactctacttggaacgggatctagggtagtgtc 6
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 5812
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 5812
Number of successful extensions: 58
Number of sequences better than 1.0e-20: 5
length of query: 966
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 950
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 9813157050
effective search space used: 9813157050
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.9 bits)